Nos quadrinhos de The Boys, a trajetória de Billy Butcher culmina em um desfecho trágico e sangrento. Após anos em busca de vingança pela morte de Becky e de caça aos supers, ele consegue alcançar seus alvos, mas isso não lhe proporciona a paz que esperava. Desse ponto em diante, Butcher se transforma na maior ameaça da narrativa.
A história de Butcher piora após o colapso do Capitão Pátria. É revelado que Black Noir era um clone criado para eliminar Homelander caso ele se tornasse um perigo. Noir é o responsável por diversos crimes, incluindo a violência que levou à morte de Becky. Em uma batalha intensa, ele derrota o Capitão Pátria, mas fica gravemente ferido. Nesse momento, Butcher se vinga, utilizando seu pé de cabra para esmagar a cabeça de Black Noir.
Com o objetivo de erradicar os supers, Butcher planeja um ataque biológico que mataria qualquer um com o Composto V no sangue, o que se tornaria um massacre em larga escala, atingindo tanto supers quanto civis. Consumido por ódio, ele não hesita em eliminar seus antigos companheiros, como Leitinho, Francês e Kimiko, que caem em suas armadilhas mortais.
O clímax da história ocorre em um confronto final com Hughie Campbell no topo do Empire State Building, onde ambos se ferem gravemente após uma luta. A paralisia de Butcher o leva a pedir que Hughie o mate. Em uma última manipulação, ele mente sobre ter matado os pais de Hughie, provocando a fúria deste e garantindo sua própria morte ao ser apunhalado.
Após a queda de Butcher, Hughie decide não seguir os passos do seu ex-líder. Ele se afasta da violência e busca recomeçar a vida ao lado de Annie January, a Luz-Estrela. Essa mudança marca um novo capítulo, onde o antigo caminho de vingança é abandonado em favor de um futuro mais esperançoso.